A importância médica e o conhecimento da composição da peçonha da maioria das serpentes colubrídeas é desconhecida. O presente trabalho teve como objetivo realizar um estudo epidemiológico retrospectivo dos acidentes por serpentes colubrídeas no Estado da Bahia, no período de 2010 a 2015 e caracterizar o perfil transcriptômico e proteômico da peçonha de Philodryas nattereri, uma serpente colubrídea com ampla distribuição geográfica no Nordeste e Centro Oeste do Brasil e em alguns outros países da América do Sul. Os dados epidemiológicos obtidos pelo SINAN evidenciam que estes acidentes por serpentes não peçonhentas no Estado da Bahia são influenciados pela densidade populacional, sendo maiores em áreas antropizadas. A média anual de casos neste período foi de 88,33 casos, o coeficiente de incidência absoluta foi de 3,53/100.000 habitantes e a incidência média anual foi de 0,587 /100.000 habitantes. Dois óbitos foram registrados, com coeficientes de mortalidade de 0,013/100.000 habitantes e taxa de letalidade de 0,377%. Neste estudo epidemiológico demonstramos uma melhoria no preenchimento das notificações por estas serpentes na Estado da Bahia e, possivelmente, nossos resultados subsidiarão estudos posteriores. Os dados transcriptômicos, utilizando sequenciamento de nova geração associado a proteômica por espectrometria de massa da peçonha de P.nattereri revelaram uma alta diversidade de compostos proteicos. A análise transcriptômica revelou uma alta diversidade de famílias de proteínas da peçonha, com a identificação de 410 transcritos agrupadas em 26 superfamílias: Type III, II and I snake venom metalloprotease (SVMP), C-type lectins (CLP), Aminopeptidase (AMP), Snake venom serine protease inhibitors (SVSPi), Veficolin (Vefico), Venom phosphodiesterase (PDE), Vascular endothelial growth factors (VEGF), Cysteine rich secretory protein (CRISP), Matrix metalloproteinase (svMMP), Snake venom serine protease (SVSP), Phospholipase A2 inhibitors (PLA2i), Venom coagulation factor (Fact), Annexin (Anx), Acetylcholinesterases (AchE), Phospholipase A (PLA), Dipeptidyl peptidase (DPP), Phospholipase B (PLB), Hyaluronidase (HYAL), Nerve growth factors (NGF), Snake venom metalloproteinases inhibitor (SVMPi), Glutamyl-peptide cyclotransferase (GPC), C-type natriuretic (NP), Cobra venom factor (CVF), Neoverrucotoxin (neoVTX), Fulgimotoxin (Ful) and xendin-3 (Exd). A caracterização proteômica através da espectrometria de massas detectou 10 das famílias de toxinas identificadas na transcriptômica, o equivalente a 33% dos compostos protéicos traduzidas na peçonha. Aqui, também descrevemos a otimização da técnica de extração de peçonha das serpentes colubrídeas através da conferencia de uma maior mobilidade da cabeça do animal. Nossos achados revelam a complexidade da peçonha de Philodryas nattereri, com um elevado potencial químico em casos de empeçonhamento.