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Dados do Trabalhos de Conclusão

UNIVERSIDADE ESTADUAL DE FEIRA DE SANTANA
BIOTECNOLOGIA (28002016006P3)
Educação Presencial
Caracterização molecular e predição estrutural de uma manganês peroxidase de Ganoderma australe
MATHEUS BATISTA DOS SANTOS
TESE
29/03/2022

Os avanços nos estudos de biologia molecular proporcionaram o aprimoramento das técnicas de expressão heterólogas de enzimas de fungo. Essa técnica mostrou-se imensamente importante na produção em larga escala dessas proteínas afim de atender as demandas industriais. Alguns gêneros de fungos filamentosos, como o Ganoderma, se tornaram essenciais para a produção de lignases por meio da expressão heteróloga, colaborando, dessa forma, para a deslignificação de resíduos agroindustriais, por exemplo. Com isso, o objetivo desse trabalho é sequenciar o gene de expressão de uma manganês peroxidase do fungo Ganoderma australe cultivado em bagaço de cana de açúcar e finalizar com a visualização e análise da estrutura tridimensional da enzima. O sequenciamento obtido foi alinhado com outras sequências de manganês peroxidase de banco de dados, com isso, a mesma sequência foi utilizada para a produção da estrutura 3D. A sequência obtida de Ganoderma australe pela extração de RNA (SEQ), comparada com a sequência já depositada no banco de dados NCBI (DQ267753.1), mostrou identidade de 96,22%. Na construção da estrutura 3D das sequências no software Swiss Model, os valores de GMQE e QMEAN da SEQ foi de 0,87 e -0,63, respectivamente. Já os valores de GMQE e QMEAN da DQ267753.1 foram de 0,87 e -0,71, respectivamente. A partir da análise do gráfico de Ramachandran, o modelo de SEQ e DQ267753 apresentaram mais de 90% de resíduos de aminoácidos em regiões favoráveis. Na sobreposição entre a SEQ e a estrutura molde que teve a maior cobertura no Swiss Model (4bm2.1) no software PyMol, apresentou um RSDM de 0,090 Å. A partir dos resultados obtidos, a SEQ é uma candidata para ser utilizada nas etapas de expressão heteróloga, purificação, caracterização bioquímica e deslignificação no resíduo lininolíticos como o bagaço de cana.

Ligninases;Resíduos Agroindustriais;Deslignificação;Fungo filamentoso;Modelagem Comparativa
Advances in molecular biology studies provided the improvement of heterologous expression techniques of fungal enzymes. This technique proved to be immensely important in the large-scale production of these proteins in order to meet industrial demands. Some genera of filamentous fungi, such as Ganoderma, have become essential for the production of ligninases through heterologous expression, thus contributing to the delignification of agro-industrial waste, for example. Therefore, this work aims to sequence the expression gene of a manganese peroxidase of the fungus Ganoderma australe cultivated in sugarcane bagasse and to finish with the visualization and analysis of the three-dimensional structure of the enzyme. The sequencing obtained was aligned with other database manganese peroxidase sequences, thus, the same sequence was used for the production of the 3D structure. The obtained sequence of Ganoderma australe by RNA extraction (SEQ), compared with the sequence already deposited in the NCBI database (DQ267753.1), showed 96.22% identity. In the construction of the 3D structure of the sequences in the Swiss Model software, the GMQE and QMEAN values of the SEQ were 0.87 and -0.63, respectively. The GMQE and QMEAN values of DQ267753.1 were 0.87 and -0.71, respectively. From the analysis of the Ramachandran plot, the model of SEQ and DQ267753 showed more than 90% amino acid residues in favorable regions. The overlap between the SEQ and the mold structure that had the highest coverage in the Swiss Model (4bm2.1) and in the PyMol software, it presented an RSDM of 0.090 Å. Based on the results obtained, the SEQ is a candidate to be used in the heterologous expression, purification, biochemical characterization and delignification steps of the lignolytic residue such as sugarcane bagasse.
Ligninases;Agro-industrial wastes;Deslignification;Filamentous Fungi;Comparative Modeling
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PORTUGUES
UNIVERSIDADE ESTADUAL DE FEIRA DE SANTANA
O trabalho possui divulgação autorizada
Matheus Batista dos Santos_Tese_PPGBiotec_UEFS.pdf

Contexto

BIOTECNOLOGIA COM ÊNFASE EM RECURSOS NATURAIS DA REGIÃO NE
ANÁLISE ESTRUTURAL E FUNCIONAL DE MACROMOLÉCULAS DE MICRORGANISMOS, ANIMAIS E PLANTAS COM POTENCIAL BIOTECNOLÓGICO
Caracterização estrutural e funcional de genes e proteínas de microrganismos, animais e plantas com potencial biotecnológico

Banca Examinadora

RAQUEL GUIMARAES BENEVIDES
DOCENTE - PERMANENTE
Sim
Nome Categoria
BRUNO SILVA ANDRADE Docente - PERMANENTE
RAQUEL GUIMARAES BENEVIDES Docente - PERMANENTE
MARILIA LORDELO CARDOSO SILVA Participante Externo
BRUNO LOPES DE SOUSA Participante Externo
RAFAEL DA CONCEICAO SIMOES Participante Externo

Financiadores

Financiador - Programa Fomento Número de Meses
FUND COORD DE APERFEICOAMENTO DE PESSOAL DE NIVEL SUP - Programa de Demanda Social 48

Vínculo

Colaborador
Outros
Outros
Não
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