Vivemos em um mundo em constante transformação e avanço e, em decorrência disso, a sociedade atual exige cada vez mais indivíduos criativos, críticos, reflexivos, autônomos e atuantes. A escola desempenha um papel fundamental na formação cidadã, fornecendo os conhecimentos, habilidades e competências necessários. No entanto, o processo de ensino e aprendizagem nem sempre ocorre de maneira desejada, devido à abordagem didática utilizada. Paralelamente a isso, é preciso destacar um grande desafio enfrentado pelos professores no contexto educacional, a baixa intensidade e má qualidade da motivação dos alunos para estudar e aprender. Diante disso, é imprescindível repensar os métodos de ensino que se baseiam predominantemente em aulas expositivas e diretivas, e buscar novas abordagens metodológicas que permitam aos estudantes desempenhar um papel ativo na construção do conhecimento. Uma estratégia do Ensino Híbrido, conhecida como Modelo de Rotação por Estações, surge como alternativa eficaz para ampliar as possibilidades de aprendizagem. Neste âmbito, o objetivo geral estabelecido para esta pesquisa consiste em investigar a contribuição da estratégia didático-pedagógica de Rotação por Estações para o desenvolvimento de aspectos de aprendizagem e qualidade motivacional dos estudantes em aulas de Ciências no Ensino Fundamental. Para alcançar esse objetivo, realizamos uma intervenção didático-pedagógica que incluiu a implementação de quatro Atividades Didáticas baseadas na Rotação por Estações, estruturadas a partir dos diferentes suportes à autonomia. A Teoria da Autodeterminação foi utilizada como base teórica para analisar os aspectos relacionados à motivação dos alunos. A intervenção foi conduzida em duas turmas do 6º ano do Ensino Fundamental em aulas de Ciências, em uma escola particular na cidade de Joinville, Santa Catarina. Coletamos dados por meio de questionários pré e pós-teste, escala de medida de motivação, produções dos alunos e observações diretas (diário de campo e gravações de áudio), gerando análises qualitativas e quantitativas. Os resultados indicam que a perspectiva didático-pedagógica da Rotação por Estações possui potencial para promover a motivação autônoma dos estudantes, contribuindo significativamente para o desenvolvimento da aprendizagem.