As águas superficiais da bacia hidrográfica do rio Pirapó são utilizadas para o abastecimento de diversas cidades e da agricultura, na região Noroeste do estado do Paraná, portanto, torna se necessário um estudo de monitoramento da qualidade da água (parâmetros físicos, químicos e microbiológicos). No Paraná a Portaria da Superintendência dos Recursos Hídricos e Meio Ambiente n°004/91 enquadra todos s cursos da Bacia do rio Pirapó como pertencentes à classe 2, e é este enquadramento que determina, em concordância com a resolução CONAMA n°357/2005, os limites de cada substância avaliada neste trabalho. O monitoramento da qualidade da água definiu 9 pontos de amostragens alocados da nascente a foz do rio Pirapó, nos quais foram avaliados parâmetros físicos, químicos e biológicos, de acordo com metodologia American Public Health Association - Standard Methods for the Examination of Water and Wastewater para a determinação dos parâmetros em laboratório. A avaliação dos parâmetros físico-químicos e microbiológicos considerou os tipos de solos da bacia hidrográfica, como também a precipitação registrada em estações pluviográficas durante o período de monitoramento. A partir dos resultados obtidos em laboratório a análise de componentes principais mostrou que as variáveis de monitoramento estão relacionadas ao tipo de poluição, difusa e pontual, sendo os compostos nitrogenados (nitrito, nitrato e nitrogênio amoniacal), fósforo total, representaram os principais parâmetros em desacordo com enquadramento de classe 2, classificando o rio Pirapó em classe 3 ou 4. O Índice de Qualidade das Águas (IQA), adaptado pela CETESB, foi utilizado de forma a sintetizar e facilitar a compreensão das informações obtidas por meio dos parâmetros de qualidade da água. O IQA calculado permitiu classificar a qualidade da água superficial como de “boa” qualidade em todo o trecho monitorado. A determinação de metais indicou grande variabilidade destes compostos em todos os trechos de monitoramento. Neste trabalho verificou-se que existe alta correlação entre o tipo de solo e da precipitação com o indicador de qualidade da água. Em relação aos pesticidas organoclorados, foi avaliado o desenvolvimento de métodos de identificação e de extração desses compostos para estudos de monitoramento na bacia do rio Pirapó.