Os óleos essenciais de plantas medicinais são conhecidos por promover ações farmacológicas podendo ainda se ligar a proteínas e esteróides promovendo mudanças estruturais na parede celular e membrana de fungos levando à deformação e morte das células. Inúmeras espécies vegetais apresentam mecanismos de adaptação e defesa fazendo uso de seusmetabólitos secundários, que por vezes pode representar novas possibilidades de estruturas fitoquímicas com potencial para ensaios biológicos. O presente trabalho buscou novas substâncias para ajudar a reduzir a proliferação de Candida tropicalis in vitro. As cepas de Candida tropicalis (ATCC 750 e 18803) foram expostas aos óleos essenciais de Schinus terebintifolius Raddi e Eugenia uniflora L. após 24h de tratamento, foram analisadas pelo método MTT. A avaliação da citotoxidade em esplenócitos murinos e os ensaios de integridade da mitocôndria das cepas foram mensurados por citometria de fluxo utilizando como sonda timidia e rodamina 123 respectivamente. As alterações estruturais foram observadas por microscopia eletrônica de varredura. Os metabólitos secundários presentes nos extratos foram identificados por cromatografia gasosa. As concentrações de 0,01, 0,1, 1, 10, 100 e 1000 mg/mL dos óleos essenciais de Schinus terebinthifolius e Eugenia uniflora foram testadas em cepas de Candida tropicalis revelaram uma inibição significativa da viabilidade desta cepa com o valor de p<0,05. A avaliação de citotoxicidade revelou que as concentrações encontradas para IC500,01 mg/mL de S. terebintifolius e 9,8 mg/mL de E. unifloraforam valores considerados promissores para a aplicação em formulações farmacêuticas com finalidade antifúngica. Ensaios de GC-MS identificaram nos óleos a presença de substâncias ativas tais como neral, geraniol, linalol, isopulegol e eugenol, terpenóides de reconhecidas atividade antimicrobiana. Os ensaios de citometria de fluxo demonstraram que as cepas tiveram alterações na integridade da mitocôndria após a exposição aos bioagentes utilizados neste estudo em relação ao controle CCCP e em consonância com os ensaios de MIC e MTT. A microscopia eletrônica de varredura mostrou que após a exposição aos óleos essenciais, alterações estruturais com evidente degradação da superfície e extravasamento de material citoplasmático foram observados além da redução significativa do número de Candida tropicalis. Estes resultados sugerem que os óleos essenciais de Schinus terebintifolius Raddi de Eugenia uniflora L. são promissores agentes anti-Candida e um protótipo de novos ativos para o tratamento de candidíase in vitro e em modelos murinos.