Este estudo investigou se havia associação entre polimorfismos nos genes da Lipase Lipoprotéica (LPL) e Apolipoproteína CIII (ApoC-II) com doença arterial coronariana em amostra Afrodescendente da população do estado da Bahia. Foi realizado um estudo transversal com a participação de 274 casos e 122 controles fumantes e 213 casos e 150 controles não fumantes Afro-descedentes que realizaram angiografia de coronárias devido a sintomas relacionados a DAC no serviço de hemodinâmica do Hospital Santa Isabel em Salvador/Ba. Foram considerados casos os indivíduos que apresentaram pelo menos uma placa aterosclerótica com 50% de obstrução da luz arterial em coronarias e controles aqueles que não apresentaram lesões obstrutivas no exame. Foram genotipados por técnica de PCR-RFLPseis polimorfismos no gene da LPL (T-93G, D9N, S291N, PvuII, HindIII e S447X) e um polimorfismo no gene ApoC-III (C-482T). Os resultados mostraram que os portadores do alelo -93T (TT+TG vs. GG) do polimorfismo T-93Gno gene LPL tiveram redução do risco de DAC (OR:0.435; p=0.035) e portadores do alelo 447X (XX+ SX vs. SS) do polimorfismo S447X no gene LPL apresentaram aumento no risco para DAC (OR: 1.920; p=0,046) nos fumantes mas não nos não fumantes. Homozigotos para o alelo T do polimorfismo C-482T do gene ApoC-III tiveram maior chance de terem DAC (OR: 1.816; p=0.024) quando comparados aos portadores do alelo -482C nos indivíduos fumantes mas não nos não fumantes. Os polimorfismos D9N, S291N, HindIII e PvuII no gene LPL não foram associados a DAC tanto nos fumantes quanto nos não fumantes.