Introdução: A Doença de Alzheimer (DA) é uma afecção neurodegenerativa irreversível e progressiva caracterizada pela presença de novelos neurofibrilares (NFTs), que são acúmulos intraneural da proteína Tau hiperfosforilada, responsável pela estabilização dos microtúbulos neuronais. Estudos têm evidenciado que os neurônios são capazes de reentrarem no ciclo celular, porém de maneira insuficiente para que tenha replicação completa ocasionando morte celular e consequentemente neurodegeneração. Objetivos: Caracterizar a expressão do gene que codifica a proteína TAU associada à microtúbulos (MAPT) e do gene envolvido na regulação do ciclo celular, Quinase 5 Dependente de Ciclina (CDK5) em amostras de encéfalo de pacientes com a DA e idosos sadios. Material e Métodos: Foi utilizada a técnica de PCR em tempo real (qRT-PCR) para a caracterização de 150 amostras de três regiões cerebrais (córtex entorrinal, córtex auditivo e hipocampo) de 50 encéfalos de 26 pacientes com DA e 24 idosos sadios. Resultados: Foi observada uma diminuição estatisticamente significante na expressão dos genes MAPT e CDK5 no grupo de pacientes com DA em relação ao controle idoso. Quando realizada a comparação individual entre as áreas, as regiões do córtex entorrinal e hipocampo que são áreas primariamente afetadas na DA, apresentaram diminuição estatisticamente significante dos níveis de expressão do gene CDK5 em pacientes com DA, já a expressão do MAPT não apresentou diferença quando realizada a comparação entre as áreas. Não foi observada diferença estatisticamente significante quando a expressão gênica foi comparada nas diferentes regiões cerebrais dentro dos dois grupos estudados. Conclusões: Estes resultados podem contribuir para o melhor entendimento do envolvimento dos genes CDK5 e MAPT na DA considerando as diferentes áreas cerebrais que são acometidas diferentemente de acordo com a progressão da doença e somar à escassa lireratura na busca de possíveis terapias para o retardo ou mesmo parada da progressão da doença