Trametes villosa é uma espécie de fungo promissora na despolimerização de compostos ligninocelulósicos por ser um bom produtor das enzimas LiP, Lac e MnP. Até o momento, nenhum registro das sequências desses genes está disponível, o que requer uma investigação detalhada. Primeiramente, foram utilizadas técnicas de DNA recombinante para caracterização molecular da sequência do cDNA de LiP. Em seguida, o genoma do fungo foi sequenciado, montado e anotado para obter informações estruturais e funcionais dos seus genes. Por fim, realizou-se uma anotação funcional na busca por sequências de proteínas do tipo peroxidase de Classe II e modelos 3D das sequências encontradas foram construídos por modelagem comparativa. Nos experimentos de DNA recombinante, apenas um fragmento parcial do cDNA de LiP foi obtido e relacionado a uma proteína hipotética de Trametes versicolor envolvida no processo de degradação de lignina, cuja estrutura secundária é constituída por folhas beta, diferente da formação típica de alfa hélices presentes nas enzimas do tipo peroxidase. Após o sequenciamento de T. villosa, a montagem do genoma apresentou um tamanho de 57,98 Mb com L50 de 691. Um total de 16.711 genes foram preditos, incluindo 590 genes de enzimas CAZy, diretamente envolvidas na decomposição de materiais lignocelulósicos. Após a anotação funcional, foi demonstrada a presença de duas LiPs e três MnPs putativas e suas funções como peroxidases de Classe II foram evidenciadas, com base na qualidade da sequência primária e na estrutura 3D gerada, com perspectiva de indicação para produção recombinante. A partir do genoma de T. villosa, um leque de estudos pode ser elucidado para a compreensão da biologia desse organismo, como rotas metabólicas envolvidas na degradação de lignina e atividade catalítica das suas enzimas ligninolíticas, com grandes perspectivas de aplicação em processos biotecnológicos.