Os estudos relacionados à Inovação Social (IS) chamam a atenção pois são vistos como uma alternativa para novos modelos de desenvolvimento territoriais sustentáveis, buscando o fortalecimento da agricultura familiar e de modelos agrícolas alternativos. Visa a mudança positiva na realidade das pessoas envolvidas na agricultura, e pode, inclusive, conduzir a uma mudança sistêmica e transformadora. Como forma de contribuir para este debate, esta dissertação tem como objetivo geral analisar como ocorre a inserção da IS nas ações da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA). A pesquisa foi desenvolvida com base em duas vertentes: teórica e empírica. A vertente teórica foi composta por uma revisão de documentos e artigos publicados nas principais bases de dados, a vertente empírica foi o estudo de caso do Portfólio de Inovação Social na Agropecuária da EMBRAPA. A pesquisa foi delimitada aos pesquisadores ligados ao portfólio, os dados foram coletados e analisados a partir de entrevistas semiestruturadas realizadas com quatro pesquisadores, dois ligados à direção e coordenação do portfólio, para analisar a abordagem adotada, e dois líderes de projetos, como forma de exemplificar à prática. Sendo, portanto, uma pesquisa de natureza básica classificada como um estudo de caso descritivo, que garante um delineamento adequado para a investigação de um fenômeno contemporâneo dentro de seu contexto real. Como principais resultados temos que a absorção da IS se dá por projetos “de baixo para cima” (bottom-up) e da implementação de algumas premissas antes não consideradas necessárias para todas as fases de um projeto, são elas: a participação ativa da comunidade, a atenção à dinâmica social, a construção coletiva, a preservação e diálogo do conhecimento tradicional com o científico, o trabalho com mais de uma dimensão (social, econômica e ambiental), especificar o ganho para a comunidade, especificar o contexto ou território que será trabalhado e considerar a continuidade do projeto. Foram observados dois aspectos da IS: a construção das redes (locais e sistêmicas) e a relação da comunidade com a tecnologia social desenvolvida (o produto). Os pesquisadores indicaram como principais facilitadores a presença de diversos parceiros, os recursos financeiros e o histórico de ações ao longo do tempo. Dentre os principais desafios do portfólio de IS estão a construção de indicadores de mensuração dos resultados da IS e a internalização dos conceitos de IS junto aos pesquisadores da empresa. Este estudo contribuiu para o avanço do conhecimento na compreensão da IS nas áreas rurais brasileiras e suas reflexões encontram-se em constante construção e aprimoramento.