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Dados do Trabalhos de Conclusão

UNIVERSIDADE FEDERAL DO ESPÍRITO SANTO
CIÊNCIAS FISIOLÓGICAS (30001013002P8)
USO DA ESPECTROSCOPIA ATR-FTIR NA TRIAGEM DA COVID-19 A PARTIR DA SALIVA
WENA DANTAS MARCARINI
TESE
17/06/2024

Introdução: Em dezembro de 2019 foi relatado à Organização Mundial de Saúde o surto do novo coronavírus. O SARS-CoV-2 é um vírus envelopado com RNA de fita simples de sentido positivo. A proteína Spike é a principal glicoproteína de superfície do coronavírus, pertence às proteínas de fusão viral classe I, e essa proteína é essencial na patogênese, transmissão e virulência do SARS-CoV-2. Atualmente, o padrão ouro para detecção do vírus é o RT-PCR; no entanto, é necessário um método de detecção mais rápido, econômico, multilocal para identificação do vírus, uma vez que é uma necessidade técnica para a prevenção e controle da infecção por SARS- CoV-2. Assim, aplicou-se nesse estudo o método de espectroscopia na região do infravermelho com transformada de Fourier (FT-IR) que é técnica analítica que possui uma elevada sensibilidade e resolução, utilizada para identificar grupos funcionais presentes em amostras biológicas. Objetivo: Propor uma metodologia de triagem como uma nova ferramenta para auxiliar no diagnóstico da COVID-19. Metodologia: foi utilizado uma amostragem por conveniência, os pacientes sintomáticos assinaram o TCLE para poder participar da pesquisa, após a coleta para RT-PCR os mesmos pacientes expeliram a saliva em um tubo estéril para posteriormente analisar essas amostras no equipamento FT-IR. Resultados: Nesta pesquisa foram incluídos 237 pacientes, sendo 138 (58%) pacientes com RT-PCR positivo e 99 (42%) com teste negativo, em relação a idade mais prevalente foi em jovem, os sintomas mais prevalentes foram febre, tosse, coriza, odinofagia e cefaleia, em relação as comorbidades, o maior índice foi hipertenso e diabético. Referente a análise espectroscópica, os espectros do FT-IR foram avaliados por meio de floresta aleatória não supervisionada (URF) e modelos aprendizagem de máquina para classificação. Conclusão: Na área da espectroscopia notou-se que os modelos quimiométricos complementaram as análises e proporcionou uma sensibilidade e especificidade alta, bem como uma notável precisão para detecção do vírus em pacientes com sintomas de COVID-19. Assim, almejamos que no futuro, tenhamos mais avanços na área da espectroscopia, para auxiliar na triagem em massa dos pacientes e até mesmo auxiliar no diagnóstico de outras doenças.

Espectroscopia ATR-FTIR;Biofluido;COVID-19;SARS-CoV-2
Introduction: In December 2019, the outbreak of the novel coronavirus was reported to the World Health Organization. SARS-CoV-2 is an enveloped virus with positive- sense single-stranded RNA. The Spike protein is the main surface glycoprotein of the coronavirus and belongs to class I viral fusion proteins; this protein is essential in the pathogenesis, transmission, and virulence of SARS-CoV-2. Currently, the gold standard for virus detection is RT-PCR; however, a faster, more cost-effective, and multilocal detection method is needed for virus identification, as it is a technical necessity for the prevention and control of SARS-CoV-2 infection. Thus, this study applied Fourier-transform infrared spectroscopy (FT-IR), an analytical technique with high sensitivity and resolution used to identify functional groups present in biological samples. Objective: To propose a screening methodology as a new tool to assist in the diagnosis of COVID-19. Methodology: A convenience sampling was used, and symptomatic patients signed the informed consent form to participate in the research. After the RT-PCR sample collection, the same patients expelled saliva into a sterile tube for subsequent analysis using the FT-IR equipment. Results: This study included 237 patients, with 138 (58%) testing positive by RT-PCR and 99 (42%) testing negative. The most prevalent age group was young adults. The most common symptoms were fever, cough, runny nose, sore throat, and headache. Regarding comorbidities, hypertension and diabetes had the highest incidence. For the spectroscopic analysis, the FT-IR spectra were evaluated using unsupervised random forest (URF) and machine learning models for classification. Conclusion In the area of spectroscopy, it was noted that chemometric models complemented the analyzes and provided high sensitivity and specificity, as well as remarkable precision for detecting the virus in patients with COVID-19 symptoms. Therefore, we hope that in the future, we will have more advances in the area of spectroscopy, to assist in the mass screening of patients and even assist in the diagnosis of other diseases.
COVID-19;SARS-CoV-2;Biofluid;ATR-FTIR Spectroscopy.
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PORTUGUES
UNIVERSIDADE FEDERAL DO ESPÍRITO SANTO
O trabalho possui divulgação autorizada
6 Tese final Wena Dantas Marcarini- PPGCF (2).pdf

Contexto

FISIOLOGIA
NEUROCIENCIAS
Aprendizagem de máquina e bioespectroscopia para desenvolvimento de técnicas de diagnóstico e decisão clínica não invasivos

Banca Examinadora

VALERIO GARRONE BARAUNA
DOCENTE - PERMANENTE
Sim
Nome Categoria
LUIS FELIPE DAS CHAGAS E SILVA DE CARVALHO Participante Externo
RITA GOMES WANDERLEY PIRES Docente - COLABORADOR
ANTONIO FERREIRA DE MELO JUNIOR Egresso - Doutorado
VALERIO GARRONE BARAUNA Docente - PERMANENTE
LIVIA CARLA DE MELO RODRIGUES Docente - PERMANENTE

Financiadores

Financiador - Programa Fomento Número de Meses
FUND COORD DE APERFEICOAMENTO DE PESSOAL DE NIVEL SUP - Programa de Demanda Social 48

Vínculo

-
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-
Não
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