O objetivo deste estudo foi avaliar o impacto de dois fatores do processo de produção de alinhadores transparentes (AT) da modalidade “in office” na espessura dos dispositivos, sendo eles (A) a técnica de termoformagem empregada, e (B) a disposição unitária ou em dupla de modelos durante a termoformagem. Quartenta e três ATs do arco superior foram fabricados a partir do mesmo número de modelos tridimensionais (3D) impressos em resina, com o termoplástico polietileno tereftalato glicol modificado (PET-G) da marca Orthomundi de espessura inicial 0,63 mm (630 μm). Os AT foram divididos em dois grupos, de acordo com o posicionamento dos modelos na câmara de termoformagem, sendo (1) modelo superior unitário (Si) e (2) modelos superior e inferior em dupla (Pw). Ainda, foram separados em três subgrupos cada, de acordo com o método de termoformagem: (1) termopressurização em termopressurizadora (Si-PRT e Pw-PRT), termoformagem à vácuo em (2) termoplastificadora digital (Si-DVT e Pw-DVT) e em (3) termoplastificadora convencional (Si-CVT e Pw-CVT). A amostra foi escaneada para obtenção de imagens 3D de microtomografia. Um operador calibrado obteve medidas de espessura em 30 pontos de referência em cada AT, distribuídos entre seis dentes na arcada superior, através de ferramenta no software DataViewer (versão x 1.5.6.5). Para avaliar a confiabilidade das mensurações, o coeficiente de correlação intraclasse (ICC) foi calculado utilizando 50% da amostra, com intervalo de 15 dias entre as tomadas. A análise estatística foi realizada no software Jamovi (versão 2.3.18), adotando o nível de significância de 5%, e os dados em micrômetros (μm) foram analisados pelos ANOVAs não-paramétricos de Kruskall-Wallis e Friedman. Foi observada redução da espessura inicial em todos os AT da amostra, com afinamento significativamente menor em PRT e maior em CVT em ambas os arranjos de modelos (p<0.05 para ambos). Ainda, DVT resultou em uma distribuição anteroposterior de espessura mais uniforme que os outros métodos. A disposição de modelos em dupla apresentou redução de espessura significativamente maior que a disposição unitária (p<0.05) no hemiarco esquerdo do modelo superior, particularmente mais expressiva na região posterior em CVT. Conclui-se que a técnica de termoformagem têm influência na espessura final do AT, e que o posicionamento em dupla de modelos tem maior impacto posterior do arco.