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Dados do Trabalhos de Conclusão

UNIVERSIDADE FEDERAL DO ESPÍRITO SANTO
CIÊNCIAS FISIOLÓGICAS (30001013002P8)
USO DA ESPECTROSCOPIA NA REGIÃO DO INFRAVERMELHO MÉDIO PARA ANÁLISE QUALITATIVA E QUANTITATIVA DA CONCENTRAÇÃO DE D-DÍMERO PLASMÁTICO
BRUNA FERRO BRUN
TESE
07/10/2024

Introdução: A espectroscopia na região do infravermelho por transformada de Fourier (FTIR) tem sido uma tecnologia emergente na área médica para detecção, triagem e discriminação de diferentes doenças. A concentração de D-dímero no plasma, um produto da degradação da fibrina durante a fibrinólise, é um marcador importante na avaliação clínica, especialmente em condições de hipercoagulabilidade. No entanto, os testes atualmente disponíveis para análise de D-dímero não apresentam parâmetros satisfatórios de avaliação. Até o momento, o uso da FTIR não foi investigado quanto a sua potencialidade para análise da concentração plasmática de D-dímero. Portanto, este estudo propõe uma nova alternativa metodológica, prática e eficaz, para avaliação dos pacientes de acordo com as concentrações de D-dímero. Objetivo: Avaliar a capacidade de distinção e de quantificação das amostras de plasma humano com diferentes concentrações de D-dímero pelo uso do FTIR associado à análise multivariada de dados. Métodos: Foram analisadas 100 amostras de plasma de pacientes internados em unidade de terapia intensiva hospitalar. Após etapa de padronização de preparo e de aquisição espectral das amostras, os dados foram organizados para análises estatística e multivariada de reconhecimento de padrões. Para análise qualitativa foi realizada análise de componentes principais (PCA), como método não supervisionado; análise discriminante linear com algoritmo genético (GA-LDA) e mínimos quadrados parciais com análise discriminante linear (PLS-DA), como método supervisionado. Para análise quantitativa foi aplicado o método de regressão pelos mínimos quadrados parciais (PLS). Para as análises foi realizado um recorte na região de fingerprint dos espectros (1800 - ~1000 cm-1). Resultados: O método GA-LDA classificou efetivamente os pacientes de acordo com o valor de referência do D-dímero (≤0,5 μg/mL e >0,5 μg/mL) com 87,5% de especificidade e 100% de sensibilidade no conjunto de treinamento, e 85,7% de especificidade e 95,6% de sensibilidade no conjunto de teste. No entanto, o método PLS não apresentou parâmetros satisfatórios de quantificação da concentração de D-dímero. Conclusão: A espectroscopia FTIR demonstra ser uma ferramenta potencial para classificação de pacientes de acordo com os valores de referência para D-dímero. As análises espectrais FTIR associadas a evidências clínicas podem contribuir para um diagnóstico médico mais rápido e preciso, reduzir a morbidade do paciente e economizar recursos e demandas por profissionais.

Coágulo sanguíneo;D-dímero;FTIR;5. Aprendizagem de máquina;6. Plasma.
Introduction: Fourier transform infrared spectroscopy (FTIR) has been an emerging technology in the medical field for the detection, screening and discrimination of different diseases. The concentration of D-dimer in plasma, a product of fibrin degradation during fibrinolysis, is an important marker in clinical evaluation, especially in hypercoagulable conditions. However, currently available tests for D-dimer analysis do not present satisfactory evaluation parameters. To date, the use of FTIR has not been investigated for its potential for the analysis of plasma D-dimer concentrations. Therefore, this study proposes a new methodological alternative, practical and effective, for the evaluation of patients according to D-dimer concentrations. Objective: Evaluate the ability to distinguish and quantify human plasma samples with different concentrations of D-dimer using FTIR associated with multivariate data analysis. Methods: One hundred plasma samples from patients admitted to a hospital intensive care unit were analyzed. After the standardization stage of sample preparation and spectral acquisition, the data were organized for statistical and multivariate pattern recognition analyses. For qualitative analysis, principal component analysis (PCA) was performed as an unsupervised method; linear discriminant analysis with genetic algorithm (GA-LDA) and partial least squares with linear discriminant analysis (PLS-DA) were performed as supervised methods. For quantitative analysis, the partial least squares (PLS) regression method was applied. For the analyses, a cutout was made in the fingerprint region of the spectra (1800 - ~1000 cm-1). Results: The GA-LDA method effectively classified patients according to the reference value of D-dimer (≤0.5 μg/mL and >0.5 μg/mL) with 87.5% specificity and 100% sensitivity in the training set, and 85.7% specificity and 95.6% sensitivity in the test set. However, the PLS method did not show overwhelming parameters of D-dimer concentration quantification. Conclusion: FTIR spectroscopy has been shown as a potential tool for patient classification according to D-dimer reference values. FTIR spectral analyses associated with clinical evidence may contribute to faster and more accurate medical diagnosis, reduce patient morbidity, and save resources and demands on professionals.
1. Blood clot;2. D-dimer;3. FTIR spectroscopy;4. ATR-FTIR;5. Machine learning;6. Plasma.
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PORTUGUES
UNIVERSIDADE FEDERAL DO ESPÍRITO SANTO
O trabalho possui divulgação autorizada
Bruna F Brun_ Tese de Doutorado_Outubro.pdf

Contexto

FISIOLOGIA
NEUROCIENCIAS
Aprendizagem de máquina e bioespectroscopia para desenvolvimento de técnicas de diagnóstico e decisão clínica não invasivos

Banca Examinadora

VALERIO GARRONE BARAUNA
DOCENTE - PERMANENTE
Não
Nome Categoria
GABRIELY SILVEIRA FOLLI Participante Externo
LEANDRO DOS SANTOS Pós-Doc
LUIS FELIPE DAS CHAGAS E SILVA DE CARVALHO Participante Externo
MARA REJANE BARROSO BARCELOS Participante Externo

Financiadores

Financiador - Programa Fomento Número de Meses
FUND COORD DE APERFEICOAMENTO DE PESSOAL DE NIVEL SUP - Programa de Demanda Social 48

Vínculo

-
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Não
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